學校通常有說不出的苦衷，包括教育部門只發文要求，可卻沒有明確教師編制問題，沒有編制，就難以安排專業師資；也沒有明確性教育課由哪個部門開設，因此開設專門的性教育，完全取決于教師有無積極性，有的學校由校醫院醫生負責，有的學校由生命學院負責，有的學校由社科院校組織，有的學校則交給學生工作部門。總之，性教育在多數學校不被待見，在院系和職能部門間踢皮球。
這和學校的辦學機制有關。拿高校來說，學校并非辦學的真正主體，在開設什么課程，開展哪些教育方面，學校并無自主權，因此一味等上級部門的要求。學校對這種辦學也多有不滿，但缺乏動力改變，就是明知很重要的教育，如果上級部門不要求，或者布置得不具體，學校就很少認真去做。這種情況在高中就更普遍，在當前高考評價制度之下，高中學校關注的是學生升學考試的成績，這之外的很多教育都被邊緣化。
也有學校認為不推進性教育，乃因社會輿論對此觀念不一，在社會上還存在反對性教育的聲音，學校怎么做都吃力不討好。這種情況客觀存在，但不是學校不推進性教育的理由。恰恰相反，學校教育要扮演引領社會風氣的角色，要以科學的性教育，消除社會輿論中存在的談性色變、談艾色變。
這需要學校從育人角度出發，來重新思考對學生的培養和教育。不要說我國面臨青少年艾滋病高發的問題，就是從青少年的健康成長出發，也不能忽視這方面的教育，學校無視學生身心健康成長所需要的教育，這不是合格的教育，而只是追求功利目標的教育。
要讓學校回歸育人本質，從根本上說，在于改革現在的行政治校模式，由行政部門主導、設置教育內容，轉為真正的教育家治校。一所實行教育家治校的學校，會及時關注受教育群體的需要和變化，并結合本校的辦學定位、條件，開設有益于學生的各種教育。
在加拿大，對中學生的性教育包括同性戀的內容，這并沒有引來家長的抗議和不滿，因為性教育是門科學，同性戀是一個已無法回避的社會現象。我國青少年男男性行為已成為傳播艾滋病的重要渠道，但不少學校還是回避這一話題，覺得其太敏感，而且也沒有上級要求究竟怎么做，學校因此沒有方向。
是時候改變這種辦學局面了。性教育、防艾教育當然不是學校教育就能全部解決的問題，但學校是學生獲取知識、培養價值觀的重要場所，學校在這方面的不作為，是教育的嚴重失職。為讓學校能針對受教育的需求開展符合教育規律的教育，需要行政部門把自主權還給學校，而不是由行政部門來布置、推進某項教育。
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